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2023年重庆市沙坪坝区金黄色葡萄球菌分离株分子特征分析

陈飞张鑫武香露范晓霞刘欣容王德苗

目的了解2023年重庆市沙坪坝区金黄色葡萄球菌的分子特征，包括其分型、耐药性和毒力基因携带情况。方法对2023年重庆市沙坪坝区致病菌识别网哨点医院和疾病预防控制中心分离的20株金黄色葡萄球菌进行全基因组测序，获得其基因序列的草图。使用SKA软件构建核心基因单核苷酸多态性（coreSNPs）进化树，以分析种群结构。利用pubMLST和spa数据库进行多位点序列分型（MLST）和spa基因分型。通过耐药基因数据库CARD和毒力基因数据库VFDB预测了耐药基因和毒力基因。采用肉汤稀释法对这些菌株进行药物敏感性试验。使用Excel 2016整理和分析数据，计数资料以率或构成比表示。结果 20株金黄色葡萄球菌平均基因组大小为2 781 654 bp，平均GC含量32.71%,Q30值均大于85%。coreSNPs进化分析揭示了3个簇，簇1包含12种ST型和11种spa型的多态性。簇2均为ST59-t441型，簇3均为ST398-t1456型。药敏试验显示，所有菌株对青霉素耐药，多重耐药菌株占65.00%,MRSA检出率为35.00%，以ST59-MRSA-IVa(2B)型为主，并发现1株mecA阴性的MRSA菌株。在耐药基因分析中，共发现26种耐药基因，其中mgrA,arlR和tet(38)等基因在所有菌株中普遍存在，而mecA、aad(6)、APH(3')-IIIa、ANT(4')-Ib等基因仅在多重耐药菌株中检出。毒力基因预测显示，发现3株高毒性PVL阳性菌株。所有菌株均不携带中毒性休克综合征毒素基因tsst-1，肠毒素基因以selk和sea为主。结论 2023年重庆市沙坪坝区金黄色葡萄球菌呈现出多样化的分布特征，需要持续监测其流行趋势，特别关注耐药性和毒力因子的变化。

期数：2025,23(2)

页码：90-97

关键字：金黄色葡萄球菌;全基因组测序;药敏检测;耐药基因;毒力基因

出版日期：2025-06-25

DOI：10.19972/j.cnki.1672-2116.240058

陈飞张鑫武香露范晓霞刘欣容王德苗.2023年重庆市沙坪坝区金黄色葡萄球菌分离株分子特征分析[J].寄生虫病与感染性疾病,2025,23(2):90-97,10.19972/j.cnki.1672-2116.240058

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